Rastreamento genético liga SARS-CoV-2 a animais no mercado de vida selvagem: WebCuriosos

O vírus por trás da COVID-19 parece ter primeiro chegado aos humanos a partir de animais selvagens em cativeiro no mercado de frutos do mar de Huanan, em Wuhan, e agora um novo estudo identifica animais específicos que provável carregava o vírus.

A nova análise – de dados de ARN metagenómico recolhidos pouco depois do encerramento do mercado – também apoia a acumulação de provas da origem do SARS-CoV-2.

Os primeiros sinais de problemas ocorreram em Wuhan, capital da província chinesa de Hubei, no final de 2019. Juntamente com o agora extinto mercado de frutos do mar e animais, a cidade abriga o Instituto de Virologia de Wuhan (WIV), onde cientistas estudaram os coronavírus. .

Embora a investigação mostre que o SARS-CoV-2 não foi produzido em laboratório, o seu surgimento na mesma cidade que o WIV levantou suspeitas e inspirou especulações generalizadas. Mesmo que tenha evoluído naturalmente, por exemplo, uma teoria popular sugere que o vírus poderia ter escapado depois de os investigadores o terem recolhido na natureza.

No entanto, há poucas evidências de um vazamento de laboratório, e muitos virologistas dizem que é muito mais provável que o vírus tenha passado para os humanos a partir de um dos muitos outros mamíferos no mercado de Huanan, onde as condições eram propícias para uma propagação zoonótica.

Na esperança de maior clareza, uma equipa internacional de investigadores conduziu a nova análise dos dados recolhidos pelo Centro Chinês de Controlo e Prevenção de Doenças (CDC) no início de 2020.

“Este é um dos conjuntos de dados mais importantes que existem sobre a origem da pandemia COVID-19”, diz a autora sênior do estudo, a bióloga evolucionista Florence Débarre, do Centro Nacional Francês de Pesquisa Científica (CNRS).

“Estamos extremamente gratos que os dados existam e tenham sido compartilhados”.

Investigadores do CDC chinês entraram no mercado de Huanan no dia de Ano Novo de 2020, horas após o fechamento do mercado devido ao COVID. Embora os animais já tivessem desaparecido, a equipe coletou amostras do ambiente.

Depois de inicialmente limpar as superfícies das baias onde os animais eram mantidos, a equipe retornou dias depois para limpar mais baias, gaiolas e carrinhos e coletar amostras de ralos e esgotos.

Eles também usaram sequenciamento metatranscriptômico para revelar cada sequência de RNA de cada organismo detectado nas amostras, juntamente com algum DNA, e compararam-nas com amostras de casos iniciais de SARS-CoV-2 até 14 de fevereiro de 2020.

A equipe chinesa do CDC publicado suas descobertas em Natureza em 2023. No total, eles tinham mais de 800 amostras e, embora não especificassem quais animais eram potenciais hospedeiros intermediários do SARS-CoV-2, compartilharam seus dados de sequenciamento em repositórios de acesso aberto.

Isso permitiu a nova análise, que identifica espécies animais nas amostras através da genotipagem dos seus genomas mitocondriais, explicam os autores.

Débarre, juntamente com o primeiro autor e microbiologista Alexander Crits-Christoph e seus colegas, encontraram evidências do vírus em baias que continham animais, incluindo cães-guaxinim e civetas. Algumas amostras continham até material genético de animais e SARS-CoV-2 juntos em um cotonete.

“Muitas das principais espécies animais foram eliminadas antes da chegada das equipes chinesas do CDC, por isso não podemos ter provas diretas de que os animais estavam infectados”, disse Débarre. diz.

“Estamos vendo fantasmas de DNA e RNA desses animais nas amostras ambientais, e alguns também estão em baias onde o SARS-CoV-2 foi encontrado”, ela adiciona. “Isso é o que você esperaria num cenário em que houvesse animais infectados no mercado”.

O estudo também incluiu uma análise evolutiva dos genomas virais dos primeiros dias da COVID, procurando prováveis ​​antepassados ​​do vírus que lançou a pandemia. Os resultados sugerem que poucos ou nenhum ser humano foi infectado antes dos surtos relacionados ao mercado.

“Neste artigo, mostramos que as sequências ligadas ao mercado são consistentes com a emergência do mercado”, Débarre diz. “A principal diversidade do SARS-CoV-2 esteve no mercado desde o início.”

Com base nas suas descobertas, os autores criaram uma pequena lista de espécies animais no mercado que provavelmente serviram como hospedeiros intermediários.

O cachorro-guaxinim comum (Nyctereutes procyonoides) era o animal geneticamente mais abundante nas amostras, relatam eles, mas o material genético da civeta mascarada (Paguma larvata) também apareceu em uma barraca com RNA do SARS-CoV-2.

Ambas as espécies estavam associadas ao surto original de SARS, observam os pesquisadores, e os cães-guaxinim comuns têm uma suscetibilidade conhecida ao SARS-CoV-2.

“Estes são os mesmos tipos de animais que sabemos que facilitaram o surto original do coronavírus SARS nos seres humanos em 2002”. diz ecologista Michael Worobey, da Universidade do Arizona.

“Esta é a coisa mais arriscada que podemos fazer – pegar animais selvagens repletos de vírus e depois brincar com fogo, colocando-os em contacto com humanos que vivem no coração das grandes cidades, cujas densidades populacionais facilitam a transmissão destes vírus. espere,” Worobey adiciona.

Embora o novo estudo não prove que nenhum animal tenha sido infectado pelo SARS-CoV-2, ele oferece pistas que podem ajudar futuras investigações, além de estabelecer ainda mais o mercado de Huanan como plataforma de lançamento da COVID.

“Este artigo acrescenta outra camada às evidências acumuladas que apontam para o mesmo cenário: que animais infectados foram introduzidos no mercado em meados e finais de Novembro de 2019, o que desencadeou a pandemia”, diz o biólogo evolucionista Kristian Andersen, do Scripps Research Institute, nos EUA.

Isto é relevante não apenas para estudos retrospectivos da origem da COVID, mas também para prevenir futuras pandemias.

“Desde que a pandemia começou, há mais de quatro anos, embora tenha havido um foco maior na segurança do laboratório, pouco foi feito para diminuir a chance de um cenário zoonótico como este acontecer novamente”, disse Worobey. diz.

O estudo foi publicado em Célula.